贝尔法斯特女王大学（又名：英国女王大学）源于1810年创立的贝尔法斯特学会（Belfast Academical Institution）。女王大学也是联合王国古老的10所大学之一。 今日，贝尔法斯特学会已易名为皇家贝尔法斯特学院。1845年，女王大学的前身，即贝尔法斯特女王学院作为爱尔兰女王大学（Queen's University, Ireland）的一部分获得皇家特许状。与之同时期建立的还有柯克女王学院（Queen's College, Cork）及戈尔韦女王学院（Queen's College, Galway）。女王学院建立的初衷在于为天主教徒和长老宗信徒提供高等教育，借此抗衡当时隶属圣公会的都柏林圣三一学院。1849年，贝尔法斯特女王学院正式开张。学院的主楼由建筑师查尔斯·兰扬爵士（Sir Charles Lanyon）设计，故名为兰扬楼。学院初办学时仅有23位教授和343名学生，当时学院一部分学生没有参加本校的考试而转投伦敦大学。

随着1908年爱尔兰大学法案的通过，皇家爱尔兰大学宣告解散。由于皇家爱尔兰大学于1879年取代了爱尔兰女王大学，故原有的大学系统被拆分为两个独立的部分：爱尔兰国立大学和贝尔法斯特女王大学。

值得注意的是，直至1950年，女王大学都在伦敦的英国国会下议院占有一席（历史上仅有8所大学享此待遇）类似地，在1920年至1968年间，北爱尔兰议会有4个议席专门留给女王大学的毕业生。

2006年6月20日，女王大学宣布将投资2.59亿英镑用于更新设备、招纳人才并开展研究。该项目的结果之一麦克莱图书馆由波士顿的建筑设计事务所布里布尔芬奇（Shepley Bulfinch）协同贝尔法斯特的罗宾逊帕特森（Robinson Patterson Partnership）事务所联合设计，图书馆于2009年7月开张。图书馆命名自大学的一个主要捐助者，艾伦·麦克莱爵士（Sir Allen McClay）。2010年6月，女王大学宣布注资750万英镑，与希捷科技共同建设安盛国际研究中心（Ansin International Research Hub）。

由于北爱尔兰的特殊性，女王大学也是目前英国境内一所授予法学博士（英语：Juris Doctor，高于法学硕士）的大学。该项目学习时长三至四年，学习要求和英国高等教育体系内的博士无异。若要取得该学位，则必须完成一篇长30000字的研究论文并通过审查。